Débutée en 1283, la construction de l’église des Dominicains date pour l’essentiel de la première moitié du XIVe siècle. Elle est une œuvre majeure de l’architecture des ordres mendiants, bien que les Dominicains arrivés en 1278, aient été chassés temporairement de la ville en 1330. En 1458, un incendie endommagea la toiture et le cloître, nécessitant des travaux de reconstruction. L’installation d’un décor baroque en 1720, rompit avec l’austérité première de l’église. Elle fut durant la majeure partie du XIXe siècle allouée à des fins laïques, avant de redevenir un lieu de culte en 1898. L’église a été l’objet d’une campagne de restauration au début des années 1980 et 1990.
Vers 1475, l’atelier de Martin Schongauer réalisa le Retable des Dominicains, aujourd’hui exposé au musée Unterlinden.
Aujourd'hui et depuis 1973, l’église des Dominicains abrite le chef d’œuvre de Martin Schongauer, la Vierge au Buisson de Roses, jusqu’alors exposé à la Collégiale Saint-Martin.
